火炬接力，一直是奥运会中备受瞩目的一项活动。本届奥运会，悉尼奥组委别出心裁地让火炬进行了“水下旅行”。悉尼奥运会火炬经过严格的检验，在时速65千米的大风和热带的大雨中还可燃烧。同时，火炬还有自动熄灭功能，当火炬被倒置或放在地上10秒钟就会自动熄灭。火炬在抵达澳大利亚大陆前的最后一段路程时，著名的海洋生物学家克雷·邓肯携带潜水装置，手擎特制的火炬在大堡礁水域完成了3分钟水下传递。这是奥运史上首次进行水下火炬接力。

　　但本届奥运会的火炬接力并不总是这般美好，接力过程中经常出现意想不到的险情。例如，在墨尔本的大街上，有位观众突然跑向火炬接力选手，夺走接力者手中的火炬，并试图溜掉。这个“小偷”被当场抓住，奥运火炬在两三分钟后重新回到接力者手中。“这是有人开的一个愚蠢的玩笑。”警察局的工作人员在讲述这一事件时说，“一切都发生得很突然，很多观众甚至不明白，到底发生了什么事情”。尽管如此，开玩笑的人还是被拘留了。

　　还有一次，有一个人冲出人群穿过接力跑道，手拿着灭火器——他要扑灭火炬。圣火没有熄灭，“防火安全维护者(试图扑灭圣火的人)”反而被制服，被送到了他该去的地方。他们对圣火的攻击是徒劳的。